Thực hiện kế hoạch thanh tra kiểm tra năm 2009, từ ngày 17/3/2009 đến ngày 31/3/2009, Sở Nội vụ đã tiến hành kiểm tra việc thực hiện kết luận thanh tra năm 2008 tại 11 đơn vị: Sở Lao động Thương binh và Xã hội, Sở Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn, huyện Phú Vang, huyện Phong Điền, huyện Hương Thủy, huyện Quảng Điền, huyện Nam Đông, huyện A Lưới, huyện Phú Lộc, huyện Hương Trà và thành phố Huế.

             Sau khi kiểm tra, Sở Nội vụ đã có báo cáo số 309/BC-SNV ngày 17/4/2009 trong đó nêu lên những kiến nghị của Giám đốc Sở Nội vụ được Giám đốc các Sở, Chủ tịch UBND các huyện và thành phố Huế quan tâm xử lý, tuy nhiên còn một số tồn tại cần được khắc phục, đó là:

             - Chưa triển khai cho viên chức các trường học làm hồ sơ theo Quyết định số 06/2007/QĐ-BNV ngày 18/6/2007 của Bộ Nội vụ. Nhiều đơn vị chưa triển khai đánh giá công chức cuối năm. Một số hồ sơ cán bộ, công chức, viên chức còn thiếu các quyết định và văn bản liên quan đến cá nhân. Một số trường hợp chưa tiến hành bổ nhiệm lại quá thời gian quy định.

             - Chưa tuyển đủ số công chức cấp xã còn thiếu. Nhiều trường hợp quá thời gian tập sự nhưng chưa tiến hành bổ nhiệm ngạch. Việc khai lý lịch và lập hồ sơ cán bộ, công chức một số xã chưa đúng quy định. Chưa có quyết định xếp lại lương đối với một số cán bộ, công chức cấp xã theo nghị định 204/2004/NĐ-CP ngày 14/12/2004 của Chính phủ.

             - Bộ phận tiếp nhận và trả kết quả một số đơn vị còn hẹp. Công chức làm việc tại Bộ phận tiếp nhận và trả kết quả chưa có bảng tên. Một số đơn vị chưa tiến hành tổng kết 5 năm về cải cách hành chính và chưa đưa các lĩnh vực vào bộ phận tiếp nhận và trả kết quả theo Quyết định của UBND tỉnh...

             Để công tác Tổ chức Nhà nước đi vào nề nếp và đúng pháp luật, ngày 20/4/2009 Sở Nội vụ có công văn số 314/SNV-TTr về việc khắc phục kết luận thanh tra, kính đề nghị UBND tỉnh có Công văn chỉ đạo Giám đốc Sở Lao động Thương binh và Xã hội, Giám đốc Sở Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn, Chủ tịch UBND các huyện và thành phố Huế tiếp tục xử lý, khắc phục các tồn tại thể hiện trong Báo cáo số 309/BC-SNV ngày 17/4/2009 của Sở Nội vụ.